1990年
，潘昭仁发表了论文“山东中生代地层及孢粉组合 ”，同年 ，省区调队还编著了《山东莱阳盆地地层古生物》。

山东境内开展了石油地质科研工作
，50多年来，胜利油田等单位古生物工作者完成的介形 、孢粉
、轮藻、小型腹足等鉴定成果 ，对渤海湾周边的巨厚新生代地层对比起了支柱作用；20世纪90年代初
，山东省地质科学研究所，在汇总前人成果的基础上 ，完成了《山东省古生物手册》编制
，对600余个属种进行了描述，制作化石图版132个（未正式出版） 。

1976年至20世纪90年代 ，山东全面开展了第二轮1∶20万和1∶5万区域地质调查，对山东地层进行了划分并对古生物化石进行了系统调研
，获得了一批重要资料和成果
。

（3）20世纪90年代至今，在古生物化石专业研究方面取得了重要突破

20世纪90年代 ，张俊峰全面总结了山东山旺昆虫动物群和蜘蛛动物群
，出版了《山东山旺昆虫化石》 、《山东省山旺昆虫与蜘蛛》等专著。在专著中，通过400余个化石属种的描述和生态分析 ，展示了堪称动植物化石宝库的山旺中新世生物群总貌；由南京地质古生物研究所袁金良编写的《山东及邻区张夏组（寒武系第三统）三叶虫动物群》专著也已出版 。

2005年
，武桂春
、刘书才等在山东青州和莱芜地区做了上寒武统—下奥陶统剖面研究，获得了丰富的牙形石 ，发现了Cordylodus lindstromi（林氏肿牙形石）
，这一成果为我省寒武系与奥陶系分界和国际层型接轨提供了依据，推进了我省牙形石研究。

2000～2011年 ，山东省及各地市、县分别开展了“矿产资源总体规划
”工作
，将古生物化石保护纳入了规划中，建立了部分古生物保护区
。

山旺 、长清
、诸城、莱阳等地区 ，历来是中外地质学家 、古生物化石专家重要的野外考察和研究基地，科研、科普工作较为深入